Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTF1Q05048 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTF1Q05048 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms