Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RELQ04864 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RELQ04864 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RELQ04864 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RELQ04864 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RELQ04864 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RELQ04864 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RELQ04864 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.1 ms