Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ERCC6Q03468 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ERCC6Q03468 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ERCC6Q03468 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms