Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPCQ03188 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPCQ03188 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms