Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOP2BQ02880 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
TOP2BQ02880 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOP2BQ02880 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms