Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ALDH6A1Q02252 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ALDH6A1Q02252 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms