Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DEFA6Q01524 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DEFA6Q01524 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms