Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC5Q00444 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXC5Q00444 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXC5Q00444 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms