Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2BQ00403 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms