Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TFAMQ00059 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TFAMQ00059 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms