Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM3AP98173 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3AP98173 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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