Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITX1P78337 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITX1P78337 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX1P78337 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX1P78337 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX1P78337 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITX1P78337 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITX1P78337 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PITX1P78337 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITX1P78337 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITX1P78337 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITX1P78337 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms