Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBXN2AP68543 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN2AP68543 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms