Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTA1P68133 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTA1P68133 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms