Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBA52P62987 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBA52P62987 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBA52P62987 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA52P62987 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA52P62987 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA52P62987 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBA52P62987 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBA52P62987 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms