Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL39P62891 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL39P62891 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms