Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBX1P62877 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBX1P62877 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBX1P62877 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RBX1P62877 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBX1P62877 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBX1P62877 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBX1P62877 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBX1P62877 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RBX1P62877 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RBX1P62877 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RBX1P62877 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms