Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPFP62306 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNRPFP62306 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms