Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ROMO1P60602 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms