Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVPABLB-1P60509 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVPABLB-1P60509 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms