Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIPK4P57078 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIPK4P57078 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RIPK4P57078 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIPK4P57078 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIPK4P57078 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIPK4P57078 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIPK4P57078 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIPK4P57078 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms