Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SIK1P57059 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SIK1P57059 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SIK1P57059 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIK1P57059 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIK1P57059 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIK1P57059 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIK1P57059 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIK1P57059 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIK1P57059 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIK1P57059 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIK1P57059 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIK1P57059 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIK1P57059 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIK1P57059 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SIK1P57059 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIK1P57059 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIK1P57059 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIK1P57059 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIK1P57059 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
SIK1P57059 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIK1P57059 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIK1P57059 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIK1P57059 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK1P57059 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK1P57059 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK1P57059 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIK1P57059 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms