Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAP1L1P55209 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NAP1L1P55209 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NAP1L1P55209 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms