Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB3P54753 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB3P54753 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms