Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23BP54727 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23BP54727 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms