Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
YARSP54577 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
YARSP54577 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
YARSP54577 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YARSP54577 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
YARSP54577 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
YARSP54577 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YARSP54577 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YARSP54577 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YARSP54577 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YARSP54577 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms