Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PMS2P54278 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PMS2P54278 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PMS2P54278 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PMS2P54278 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PMS2P54278 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PMS2P54278 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PMS2P54278 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms