Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
POLR2KP53803 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLR2KP53803 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms