Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOSBP53539 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOSBP53539 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSBP53539 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSBP53539 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSBP53539 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOSBP53539 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOSBP53539 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSBP53539 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSBP53539 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSBP53539 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSBP53539 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOSBP53539 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOSBP53539 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSBP53539 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSBP53539 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSBP53539 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSBP53539 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSBP53539 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSBP53539 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOSBP53539 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOSBP53539 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOSBP53539 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOSBP53539 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOSBP53539 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms