Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACLYP53396 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACLYP53396 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACLYP53396 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACLYP53396 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACLYP53396 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACLYP53396 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACLYP53396 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACLYP53396 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACLYP53396 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACLYP53396 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACLYP53396 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACLYP53396 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms