Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDST1P52848 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDST1P52848 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDST1P52848 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDST1P52848 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
NDST1P52848 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDST1P52848 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDST1P52848 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDST1P52848 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDST1P52848 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDST1P52848 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDST1P52848 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDST1P52848 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms