Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK4P51957 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK4P51957 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK4P51957 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK4P51957 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK4P51957 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NEK4P51957 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK4P51957 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK4P51957 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK4P51957 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms