Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLCNKBP51801 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLCNKBP51801 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLCNKBP51801 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms