Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNA2P51530 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNA2P51530 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNA2P51530 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DNA2P51530 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNA2P51530 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms