Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCNN1BP51168 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCNN1BP51168 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms