Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK7P50613 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK7P50613 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK7P50613 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK7P50613 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK7P50613 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK7P50613 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK7P50613 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK7P50613 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK7P50613 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK7P50613 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK7P50613 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK7P50613 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK7P50613 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK7P50613 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDK7P50613 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK7P50613 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK7P50613 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDK7P50613 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDK7P50613 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms