Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPFP49454 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPFP49454 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPFP49454 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPFP49454 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPFP49454 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CENPFP49454 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPFP49454 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPFP49454 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPFP49454 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPFP49454 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPFP49454 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPFP49454 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPFP49454 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPFP49454 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPFP49454 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPFP49454 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms