Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPIAP49247 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPIAP49247 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPIAP49247 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPIAP49247 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPIAP49247 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms