Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITPNBP48739 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITPNBP48739 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms