Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM4SF4P48230 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM4SF4P48230 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms