Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ETV4P43268 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ETV4P43268 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ETV4P43268 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ETV4P43268 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ETV4P43268 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ETV4P43268 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ETV4P43268 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ETV4P43268 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ETV4P43268 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms