Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTTP42858 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HTTP42858 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTTP42858 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTTP42858 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTTP42858 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTTP42858 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HTTP42858 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTTP42858 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HTTP42858 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HTTP42858 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HTTP42858 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTTP42858 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HTTP42858 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTTP42858 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTTP42858 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTTP42858 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HTTP42858 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTTP42858 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HTTP42858 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms