Protein–RNA interactions for Protein: P42702

LIFR, Leukemia inhibitory factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIFRP42702 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIFRP42702 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIFRP42702 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIFRP42702 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIFRP42702 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIFRP42702 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIFRP42702 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIFRP42702 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LIFRP42702 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIFRP42702 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIFRP42702 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIFRP42702 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIFRP42702 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIFRP42702 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIFRP42702 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIFRP42702 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIFRP42702 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIFRP42702 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIFRP42702 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIFRP42702 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIFRP42702 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIFRP42702 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIFRP42702 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIFRP42702 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms