Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMPOP42166 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPOP42166 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPOP42166 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPOP42166 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPOP42166 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPOP42166 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMPOP42166 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMPOP42166 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMPOP42166 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TMPOP42166 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMPOP42166 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMPOP42166 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMPOP42166 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMPOP42166 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMPOP42166 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPOP42166 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPOP42166 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPOP42166 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPOP42166 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPOP42166 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPOP42166 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMPOP42166 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPOP42166 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPOP42166 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPOP42166 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPOP42166 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPOP42166 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPOP42166 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMPOP42166 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMPOP42166 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMPOP42166 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMPOP42166 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms