Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFSF9P41273 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNFSF9P41273 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms