Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOBEC1P41238 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms