Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL4P36578 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL4P36578 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL4P36578 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL4P36578 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL4P36578 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL4P36578 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL4P36578 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL4P36578 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL4P36578 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms