Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT9P35527 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT9P35527 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT9P35527 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT9P35527 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT9P35527 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT9P35527 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT9P35527 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT9P35527 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT9P35527 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT9P35527 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT9P35527 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT9P35527 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT9P35527 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT9P35527 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT9P35527 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT9P35527 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT9P35527 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT9P35527 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT9P35527 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT9P35527 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT9P35527 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT9P35527 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms