Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
THBS4P35443 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
THBS4P35443 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
THBS4P35443 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
THBS4P35443 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
THBS4P35443 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
THBS4P35443 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
THBS4P35443 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
THBS4P35443 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
THBS4P35443 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
THBS4P35443 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms