Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFTPDP35247 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFTPDP35247 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms